Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms