Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms