Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhot1Q8BG51 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhot1Q8BG51 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms