Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-M10.6Q85ZW5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.6Q85ZW5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms