Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms