Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc28Q80XJ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms