Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnma8aQ80VM8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms