Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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