Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms