Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms