Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms