Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smap2Q7TN29 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smap2Q7TN29 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms