Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shq1Q7TMX5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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