Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms