Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms