Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms