Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms