Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms