Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms