Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvoplQ6PDF3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvoplQ6PDF3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms