Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc4Q6PAV2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms