Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp2d40Q6P8N9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms