Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga2Q6P5E6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms