Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y5

Znf280c, Zinc finger protein 280C, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280cQ6P3Y5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Znf280cQ6P3Y5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf280cQ6P3Y5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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