Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casc4Q6P2L7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc4Q6P2L7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms