Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms