Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sohlh1Q6IUP1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms