Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt39Q6IFX4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt39Q6IFX4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms