Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KdsrQ6GV12 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms