Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Edrf1Q6GQV7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms