Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca2Q6DIC0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms