Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pram1Q6BCL1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms