Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms