Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Jmjd1cQ69ZK6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Jmjd1cQ69ZK6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Jmjd1cQ69ZK6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Jmjd1cQ69ZK6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Jmjd1cQ69ZK6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Jmjd1cQ69ZK6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Jmjd1cQ69ZK6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Jmjd1cQ69ZK6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Jmjd1cQ69ZK6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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