Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn4Q69Z26 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cntn4Q69Z26 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 465.8 ms