Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BegainQ68EF6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms