Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

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Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn3Q64691 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms