Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ca4Q64444 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ca4Q64444 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ca4Q64444 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ca4Q64444 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms