Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pan3Q640Q5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms