Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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Ccdc18Q640L5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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Ccdc18Q640L5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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Ccdc18Q640L5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc18Q640L5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms