Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms