Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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Hoxa13Q62424 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa13Q62424 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms