Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sh3gl2Q62420 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sh3gl2Q62420 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sh3gl2Q62420 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sh3gl2Q62420 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sh3gl2Q62420 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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