Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sprr1bQ62267 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms