Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sox19Q62249 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sox19Q62249 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sox19Q62249 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sox19Q62249 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sox19Q62249 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox19Q62249 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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