Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sin3bQ62141 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms