Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npm1Q61937 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms