Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms