Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itm2aQ61500 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Itm2aQ61500 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Itm2aQ61500 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itm2aQ61500 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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