Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcd1Q61466 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms